Brèves de clavier

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  • 28/04/2010

    La prochaine journée PLUME, est organisée avec le laboratoire Cléo, le 16 juin 2010 à Lyon sur le thème 'Communication scientifique en ligne : outils libres (CMS, wikis, blogs, ...), pratiques et analyses' :

  • 26/04/2010

    Une nouvelle fiche de logiciel en tests vient d'être publiée sur PLUME :

    Eyes Of Network : solution de supervision système et réseau

    mais accessible uniquement aux membres PLUME

    Si vous utilisez ce logiciel en production, contactez plume [at] services [dot] cnrs [dot] fr (plume)

  • 22/04/2010

    Extrait du site de la journée (http://www.resinfo.cnrs.fr/spip.php?article44) :

    JOSY "Authentification centralisée pour les applications web" - le 6 mai 2010 à Paris

    Objet : L’authentification est un élément central de notre sécurité. L’identification de manière unique et globalisée d’un utilisateur se connectant à une application web est devenue une nécessité, notamment du fait de la multiplication des applications accédées à distance et de la disparité au niveau géographique des services offerts.

    Cette journée va nous permettre de dresser un réel état des lieux des concepts, techniques et applications qui sont le plus utilisés au sein de notre communauté, relatifs à une authentification unique centralisée pour les applications web, que ce soit au niveau d’un laboratoire, d’une université, ou de toute la communauté Education /Recherche.

    En complément, une présentation de retours d’expériences pourra aider un administrateur système et réseau à mettre en place un système d’authentification unique pour ses applications web au sein de son unité.

    Date et lieu : jeudi 6 mai 2010 - Délégation Paris Michel-Ange du CNRS à Paris (http://www.cnrs.fr/paris-michel-ange/article.php3?...)

    Web diffusion : cette journée sera diffusée en direct sur le web grâce à la cellule Webcast du Centre de Calcul de l’IN2P3.

    Organisateurs : Olivier Boebion, Roland Dirlewanger, Anne Facq, Claude Gross, Jean-Yves Hangouët, Christian Helft, Bernard Maire-Amiot

    Programme prévisionnel :
    9h00 Accueil des participants

    Introduction
    9h30 "La problématique de l’authentification, panorama de quelques solutions (Ldap, Active Directory, Eduroam, Radius, SSO, Shibboleth, CAS, OpenId)" - Claude Gross (Unité Réseau du CNRS)

    Techniques
    10h00 "OpenID" - Dominique Fournier (CNRS/CRIC)
    * Pour quoi faire ?
    * Pour qui ?
    * Avec quelle sécurité ?

    10h30 "CAS " - Julien Marchal (Université de Nancy 2)
    * Principe de l’authentification CAS
    * Architecture CAS
    * Mise en place d’un serveur CAS

    11h00 "Shibboleth" - David Verdin (CRU)
    * Principes
    * Les applications déjà prêtes
    * "Shibboletiser" une application

    11h40 Shibboleth et Fédération Education/Recherche

    Projets utilisant Shibboleth
    12h00 "Fédération d’identité Éducation-Recherche" - Mehdi Hached (Renater)
    * Les participants
    * Son évolution

    12h20 "Le projet JANUS (gestion identite CNRS)"- Claude Gross (Unité Réseau du CNRS)
    * La gestion des identités au CNRS
    * Les applications qui l’intègrent ou qui vont l’intégrer

    12h40 Repas

    Après-midi

    Retours d’expérience (durée des presentations entre 20 à 30 mn)
    * Installation serveur OpenId
    * Installation serveur CAS
    * Installation serveur Shibboleth
    * Mise en place d’applications clientes (Apache, les CMS etc...)

  • 20/04/2010

    La cinquième édition du "libre graphics meeting" aura lieu à Bruxelles du 27 au 30 mai 2010.

    Tout est sur le site de la manifestation
    http://libregraphicsmeeting.org/2010/index.php?p=f...

    Tutoriaux, conférences, rencontres autour des logiciels graphiques et de la culture libre entre développeurs et utilisateurs.

    Les logiciels concernés comme par exemple Gimp http://www.projet-plume.org/fr/fiche/gimp , Scribus http://www.projet-plume.org/fr/fiche/scribus , Blender, Inkscape http://www.projet-plume.org/fr/fiche/inkscape et plusieurs autres sont listés dans la partie projet du site et le programme est à ce jour en cours de finalisation.

    Le site annonce également "d'importants travaux sur les systèmes de gestion ouverte de la couleur et le standard vectoriel SVG pour l'impression et le web" et "des activités spécifiques pour les étudiants des écoles d'art et de design".

  • 12/04/2010

    Annonce reservée aux membres de la communauté Ens Sup - Recherche :

    Le projet PLUME, le groupe Calcul, et le réseau DevLog travaillent sur un projet visant à réaliser une étude prospective sur l'opportunité de proposer à la communauté Enseignement Supérieur - Recherche des solutions adaptées pour l'hébergement des développements des laboratoires de recherche.

    Ce projet est décrit ici :
    http://www.projet-plume.org/fr/ressource/projet-forge-esr

    L'objectif est tout d'abord d'identifier les pratiques de développement dans la communauté Enseignement Supérieur et Recherche, au travers d'une enquête auprès de tous les membres de cette communauté amenés à développer du logiciel.

    Cette enquête sera close le 15 Mai  2010, et les premiers résultats seront communiqués à partir de Juin 2010.

    Si vous êtes membre de la communauté Enseignement Supérieur - Recherche, pour participer à cette enquête,  veuillez cliquer sur le lien :
    http://calcul.math.cnrs.fr/ForgeESR/index.php?sid=68895&lang=fr

    Nous vous engageons à diffuser ce mail auprès de vos collègues développeurs permanents ou occasionnels de la communauté Enseignement Supérieur - Recherche qui ne l'auraient pas reçu.

    Nous vous remercions pour votre contribution.

    Véronique Baudin , Violaine Louvet  : responsables du projet forgeESR

    Loic Gouarin: groupe projet forgeESR

  • 01/04/2010

    Une page spécifique PLUME a été mise en ligne pour référencer les logiciels développés dans les laboratoires de l'INSMI (Institut des Sciences Mathématiques et de leurs Interactions du CNRS) et décrits dans une fiche PLUME.

  • 01/04/2010

    Résumé des nouvelles fiches publiées sur le serveur PLUME en mars 2010 et des informations du projet.

    INFORMATIONS

    NOUVELLES FICHES PUBLIEES EN MARS 2010

    Fiches logiciels validés mises à jour

    • 29 fiches de logiciel validé déjà publiées ont été l'objet d'une MAJ complète pour leur auteur.

    Fiches logiciels validés (en production sur 3 sites au moins)

    Voir : http://www.projet-plume.org/fiches/dates_toutes

    • PDFedit : éditeur de documents PDF - Jean-Luc Laborde (CRPP)
    • MACS : logiciel d'analyse ChIP Seq (biologie) - Aubin Thomas (IGH)
    • GIMP : création et retouche d'images numériques - Anne Durand (CLEO)
    • Giac/Xcas : le couteau suisse des mathématiques - Frederic Han (IMJ)
    • NETGEN : mailleur 3D tétraédrique (modélisation) - Laurent Santandrea (LGEP)
    • Galaxy : plateforme pour analyser les données génomiques - Christelle Dantec (Institut de Génomique Fonctionelle)
    • Sage-Combinat : boîte à outils pour l'exploration informatique en combinatoire (algébrique) - Nicolas M. Thiéry (Laboratoire de Mathématiques d'Orsay)
    • FOG : clonage et déploiement de système d'exploitation et de logiciels sur des postes PCs - Stéphane Louazon (Université Rennes 2 - CRI)
    • NoScript : extension pour la famille Firefox pour bloquer les scripts - Olivier Brand-Foissac (LPT Orsay)
    • AMC : création, gestion et correction de QCM - Alexis Bienvenüe (ISFA Université Lyon 1)
    • WebCalendar : agenda en ligne, public, individuel ou pour groupe de travail - Hoby Ratsihoarana (CIRED)
    • STUdS : outil de sondage pour déterminer une date ou un lieu de réunion, un thème de travail, ..... - Guilhem Borghesi (Direction Informatique Univ. de Strasbourg)
    • KDiff3 : comparaison et fusion graphique de fichiers et de répertoires - Etienne Urbah (LAL IN2P3)
    • Emacs : éditeur de texte - Henri-Pierre Charles (PRISM)

    Fiches ressources (en lien avec des logiciels)

    Voir : http://www.projet-plume.org/ressources/dates

    • Les services de validation (Web) offerts par le W3C
    • AFUL : Association Francophone des Utilisateurs de Logiciels Libres
    • Référentiel général de sécurité (RGS)
    • Conférence COMPIL sur les bases de données pour la science janv 2010 Toulouse
    • Construire une communauté autour du Logiciel Libre
    • Association Veni, Vidi, Libri (Licences libres)
    • Etude sur les métiers de l’informatique dans les laboratoires de recherche (BAP E)

    Fiches Dév ESR (développements de la communauté Ens Sup Recherche)

    Voir : http://www.projet-plume.org/relier/dates

    • S-MART : analyse de données de séquençage haut-débit - Matthias Zytnicki (INRA URGI)
    • PowerWatershed : segmentation d'image 2D et 3D - Teresa Gomez-Diaz (LIGM)
    • Cross-Section topology : topologie des coupes pour le traitement d'images - Teresa Gomez-Diaz (LIGM)
    • Lodel : logiciel d'édition électronique - CMS orienté publication de revues électroniques - Pierre-Alain Mignot (CLÉO Revues.org)
    • BigFileSharing : transfert et partage de gros fichiers - Guenael Sanchez (Université Joseph Fourier (Grenoble 1))
    • Narcisse : navigateur de génomes comparés - Emmanuel Courcelle (LIPM)
    • NAUtil : von Neumann Analysis Utilities - Brigitte Bidegaray-Fesquet (LJK)

    Fiches Dév ESR en anglais

    Voir : http://www.projet-plume.org/en/relier/list_by_date

    • ChemAzTech : chemical product library & management software
    • PowerWatershed : 2D and 3D image segmentation
    • Cross-Section topology : topology for image processing
    • Critical kernels : parallel thinning and skeletons in any dimension
    • String process : implementation of algorithms for automatic processing of natural language
    • pyQPCR : analysis of real-time quantitative PCR data supplying relative quantifications
    • CreaTools : development framework for medical image-processing software
  • 24/03/2010

    Le projet PLUME, en collaboration avec les réseaux Calcul et DevLog, organise une école d'automne dédiée au développement des logiciels en environnement de recherche : l'école ENVOL.

    Cette deuxième édition est la suite logique de celle qui a été organisée en 2008 portant sur la valorisation de ces développements.

    ENVOL 2010 propose une vision plus concrète des outils et pratiques de développement.

    Cette école aura lieu du 27 septembre au 1er octobre 2010 à Autrans.

    Toutes les informations pratiques, ainsi que le contenu du programme sont en ligne :

    http://www.projet-plume.org/prog-envol2010

  • 16/03/2010

    Message de Maurice Libes (maurice [dot] libes [at] univmed [dot] fr) :

    Dans le cadre des formations nationales angd ("action nationale a gestion déconcentrée" du CNRS) proposées par RESINFO, nous organisons cette année une formation sur le thème :

    Présentation du référentiel ITIL et de la norme iso 20000 – Utilisation dans l'organisation des services informatique des unités de recherche

    Objectif: joindre l'ITIL à l'agréable, les principaux renseignements sont disponibles ici:

    - http://www.resinfo.org/spip.php?article43

    - http://www.resinfo.org/IMG/pdf/fiche-annonce-angd-itil.pdf

    La formation aura lieu les 5,6,7 Mai au centre CNRS de Frejus (hébergement sur la villa Clythia, avec arrivée le 4 au soir pour un démarrage le 5 matin).

    Le formateur M.Prunier est spécialisé dans le domaine de l'organisation des SI et les principaux référentiels (normes, bonnes pratiques).

    La formation présentera les bases, la fonction des processus ITIL, une partie de la formation sera consacrée à une étude de cas pratique dans le contexte d'une unité de recherche... comment et par quoi commencer ?

    Le nombre de places est limité à 30 personnes... et la date limite d'inscription le 2 Avril 2010.

    Très cordialement et à bientôt

    Pour tout renseignement contacts : M. Libes (maurice [dot] libes [at] univmed [dot] fr) et A. Facq (annefacq [at] crpp-bordeaux [dot] cnrs [dot] fr)

  • 03/03/2010

    Ci-dessous un résumé des nouvelles fiches publiées sur le serveur PLUME et des actions du projet dans les 2 premiers mois de l'année 2010. Pour être tenu au courant au fil de l'eau, abonnez vous au fil RSS PLUME.

    INFORMATI0NS

    Statistiques

    • En février : 1 519 000 hits, 209 000 pages vues
    • Fin février : 1097 membres, 492 contributeurs, 569 fiches en ligne
    • Fiches logiciels validés les plus lues en février : Redmine, Filex, GLPI, Zotero, Joomla, Plugin Visual Editor de Eclipse, Wireshark, Bibus, OCSI, gvsig, Drupal, Iperf
    • Fiches ressources les plus lues en février : Doodle, Journée PLUME LL Maths, UML, Cours LL, Journée PLUME outils biblio, Sourceforge, Zoom outils biblio, Studs, Forge ESR, FAQ Licences

    Détails : http://www.projet-plume.org/le-projet-tableau-de-bord

    Journées PLUME

    • Avec le groupe calcul : ‘Les alternatives libres aux outils propriétaires de maths’ le 4 février 2010 à Paris. Présentations et vidéos enregistrées : http://www.projet-plume.org/ressource/journee-plume-outils-libres-math
    • Prochaine journée, avec le laboratoire Cléo, le 16 juin à Lyon : 'Communication scientifique en ligne : outils libres (CMS, wikis, blogs, ...), pratiques et analyses'

    NOUVELLES FICHES PUBLIEES LES 2 PREMIERS MOIS DE L'ANNEE 2010

    Fiches logiciels validés mises à jour

    39 fiches de logiciel validé déjà publiées ont été l'objet d'une MAJ complète pour leur auteur.

    Fiches logiciels validés (en production sur 3 sites au moins)

    http://www.projet-plume.org/fiches/dates_toutes

    • FactoMineR : package du logiciel R dédié à l'analyse de données - Julie Josse (Laboratoire de mathématiques appliquées Rennes Agrocampus Ouest)
    • ORI-OAI : Outil de Référencement et d'Indexation pour un réseau de portails OAI-PMH - Yohan Colmant (Univ de Valenciennes et du Hainaut Cambrésis - Service informatique)
    • TortoiseSVN : client Windows de système de gestion de version (SVN) - Jean-Michel Glorian (CESR (OMP))
    • MixNet/MixeR : statistiques : Mixture Models for Networks - Vincent Miele (LBBE)
    • Ariane : analyse lagrangienne de la dynamique de modèles numériques de circulation océanique - Nicolas Grima (Laboratoire de Physique des Océans - Brest)
    • FOSSology : faciliter l'analyse des licenses des logiciels libres - solution d'audit de code - Olivier Lebeltel (LRI)
    • FEMM : solveur éléments finis pour le calcul de champs électromagnétiques en basse fréquence - Laurent Santandrea (LGEP)
    • CiGri : grille de calcul “légère” - Bruno Bzeznik (Projet CIMENT de l'Université Joseph Fourier)
    • Spyder : environnement de développement Python (et C, C++, Fortran) : Pierre Raybaut - (CEA/DAM Île-de-France)
    • Rheolef : résolution des équations aux dérivées partielles par la méthode des éléments finis - Pierre Saramito (LJK Grenoble)

    Fiches logiciel à valider (en production sur 1 site)

    http://www.projet-plume.org/logiciels_a_valider

    • PISTOU : gestion des notices bibliographiques dans un laboratoire - Isabelle Guillet (LIG)
    • Image Markup Tool (IMT) : outil d'annotation et de description d'images - Marjorie Burghart (Histoire et Archéologie des Mondes Chrétiens et Musulmans Médiévaux)

    Fiches ressources (en lien avec des logiciels)

    http://www.projet-plume.org/ressources/dates

    • Présentations et vidéos de la journée PLUME - Groupe Calcul ‘Les alternatives libres aux outils propriétaires de maths’ 02/2010
    • Le logiciel libre dans un laboratoire de recherche en chimie
    • Méthode pour tracer la propriété intellectuelle dans des codes logiciels
    • Livre blanc sur les logs de l'OSSIR
    • Format BAR : Binary ARchive (Génome)
    • S'approprier un serveur Apache
    • Présentations du Tutojres de février 2010 "sécurité des sites web"
    • Format GFF : General Feature Format (Génome)
    • Projet de forge Ens Sup Recherche - le périmètre restant à définir
    • Cours Logiciels libres (janvier 2010)
    • EOLE : distribution de logiciels permettant d'installer des serveurs réseau Internet-Intranet
    • La place des logiciels libres dans l'Enseignement Supérieur et la Recherche, dans l'administration, en France, en Europe et dans le monde
    • Bilan 2009 et projets 2010 du projet et de la plate-forme PLUME
    • FOSSbazaar : forum sur la gouvernance du libre
    • FranceTerme : les termes recommandés au Journal Officiel
    • QualiPSo : projet européen pour renforcer l'utilisation des logiciels libres

    Fiches Dév ESR (développements de la communauté Ens Sup Recherche)

    http://www.projet-plume.org/relier/dates

    • coxeter : combinatoires sur les groupes de Coxeter - Violaine Louvet (Institut Camille Jordan)
    • SCSCP C Library : bibliothèque de communication entre systèmes de calcul formel - Mickael Gastineau (IMCCE)
    • cses : service web pour la rédaction des rapports et l’aide à la décision des commissions de spécialistes - Agnès Joly Carrette (ICJ)
    • NemoFish : analyse d'image pour les gènes et territoires chromosomiques en FISH 3D - Eddie Iannuccelli (LGC INRA Toulouse)
    • CreaTools : cadre de développement pour logiciels de traitement d'images médicales - Maciej Orkisz (CREATIS, service de développements logiciels scientifiques)
    • GAGG : algorithme (codé en R) qui permet le clustering de gènes - Florian Salipante (IGF - Contrôle de l'apoptose et de la prolifération dans les systèmes neuronaux et endocriniens)
    • HIPS : solveur de systèmes linéaires creux - Pascal Hénon (INRIA Bordeaux)
    • j-chkmail : filtre antispam/antivirus pour des passerelles de messagerie - Jose-Marcio Martins da Cruz (CCSI Ecole des Mines de Paris)
    • libcrn : boîte à outils de traitement d'images - Yann Leydier (LIRIS)
    • Manlab : continuation interactive et analyse de bifurcation de problèmes non-linéaires - Stéphane Lejeunes (LMA, Marseille)
    • ChemAzTech : logiciel de type chimiothèque - Rémy Dernat (IBMM)
    • Giac/Xcas : le couteau suisse des mathématiques - Bernard Parisse (Institut Fourier)
    • ESPript : visualisation d'alignements multiples corrélés à la structure secondaire - Patrice Gouet (IBCP Lyon)
    • MPFR : bibliothèque de calcul à virgule flottante en précision arbitraire avec arrondi correct - Philippe Theveny (INRIA Grenoble - Rhone Alpes)
    • MPC : bibliothèque de calcul sur les nombres complexes à virgule flottante en précision arbitraire - Philippe Theveny (INRIA Grenoble - Rhone Alpes)
    • GetFem++ : biblothèque C++ d'éléments finis interfacée scilab-python-matlab - Yves Renard (ICJ)
    • heegner_twist : calcul par la méthode de Heegner du générateur d'une tordue quadratique de rang 1 - Xavier Roblot (ICJ)
    • ellanalyticrank : calcul du rang analytique d'une courbe elliptique définie sur Q - Xavier Roblot (ICJ)
    • Stochastic Downscaling Method : méthode stochastique pour le raffinement d’échelle en mécanique des fluides - Antoine Rousseau (Laboratoire Jean Kuntzmann Grenoble)
    • Krig-SL : équation d'advection, méthodes semi-lagrangienne et de krigeage - Daniel Le Roux (ICJ)
    • padicfields : calcul des extensions de degré donné d'un corps p-adique - Xavier Roblot (ICJ)
    • VElasOldroyd : résolution des problèmes d'écoulement de fluides viscoélastique (loi d'Oldroyd) - Abdelmalek Zine (ICJ et Ecole Centrale de Lyon)
    • NS2DVV : résolution du problème de Navier-Stokes à viscosité variable avec adaptation de maillage - Abdelmalek Zine (ICJ et Ecole Centrale de Lyon)
    • CDiffA : résolution des problèmes de convection-diffusion avec adaptation de maillages - Abdelmalek Zine (ICJ et Ecole Centrale de Lyon)
    • SCarr2DA : résolution du problème de Stokes à viscosité variable avec adaptation de maillage - Abdelmalek Zine (ICJ et Ecole Centrale de Lyon)
    • MiGAL : simulation de l'effet Leidenfrost - Houssam Khalil (LJK)
    • Ocean-eddy : équations de Saint Venant en océanographie - Daniel Le Roux (ICJ)
    • BOMBEC : simulation du couplage fluide-structure en coordonnées eulériennes - Emmanuel Maitre (LJK)
    • DisocclusionEuler : reconstruction de parties manquantes dans une image numérique 2D - Simon Masnou (Institut Camille Jordan)
    • GeoGuidePatchReproduce : reconstruction de parties manquantes dans une image numérique 2D par copier-coller avec guidage - Simon Masnou (Institut Camille Jordan)
    • PatchReproduce : reconstruction de parties manquantes dans une image numérique 2D par copier-coller d'échantillons - Simon Masnou (Institut Camille Jordan)
    • FLEXIBLE : déformation et changement de conformation biomolécules par excitations externes (Modes Statiques) - Mehdi Djafari Rouhani (LAAS)
    • OXCAD : simulation multi-échelle de l’oxydation du silicium : surface, multicouches et mésoscopique - Mehdi Djafari Rouhani (LAAS)
    • VIBRATOM : dynamique vibrationnelle des systèmes désordonnés. Simulation des spectres IR et Raman - Mehdi Djafari Rouhani (LAAS)
    • Rheolef : résolution des équations aux dérivées partielles par la méthode des éléments finis - Pierre Saramito (LJK Grenoble)
    • HIKAD : simulation à l’échelle atomique du dépôt des matériaux fortes permittivités par le procédé ALD - Mehdi Djafari Rouhani (LAAS)
    • SPARCC : croissance hétéroépitaxiale des semiconducteurs avec caractérisation in situ RHEED et photoémission - Mehdi Djafari Rouhani (LAAS)
    • Monolix : analyse de modèle non-linéaire à effets mixtes -XXXX (IRD DSI - IS)

    Fiches Dév ESR en anglais

    http://www.projet-plume.org/en/relier/list_by_date

    • libcrn : image processing toolkit
    • Giac/Xcas : the swiss knife for mathematics
    • GetFem++ : finite element C++ library interfaced with scilab-python and matlab
    • Stochastic Downscaling Method : downscaling stochastic method for computational fluid dynamics
    • MARS : software tool for the assessment of ageing and maintenance efficiency of systems
    • MiGAL : simulation of Ledeinfrost effect
    • BOMBEC : fluid-structure models based on eulerian concepts
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