Les fiches DevESR suivies par le responsable thématique CDantec

Dans le projet PLUME, chaque responsable thématique a en charge un certain nombre de fiches qu'il n'a pas rédigées mais qu'il suit (contact direct avec l'auteur, relecture, mise à jour...).

Logiciel Description Etat Langue
Ed'Nimbus

DNA sequence filtering

Fiche Dev ESR Publié Anglais
NemoFish

three-dimensional fluorescence in situ hybridization (3D-FISH)

Fiche Dev ESR Publié Anglais
pyQPCR

analysis of real-time quantitative PCR data supplying relative quantifications

Fiche Dev ESR Publié Anglais
Narcisse

navigateur de génomes comparés

Fiche Dev ESR Publié Français
GAGG

algorithme (codé en R) qui permet le clustering de gènes

Fiche Dev ESR Publié Français
pyQPCR

traiter les données de PCR quantitative pour obtenir les quantifications relatives ou absolues

Fiche Dev ESR Publié Français
GAGG

algorithm (R code) allowing gene clustering

Fiche Dev ESR Publié Anglais
FactoMineR

package du logiciel R dédié à l'analyse de données

Fiche Dev ESR Publié Français
Narcisse

compared genomes browser

Fiche Dev ESR Publié Anglais
BioMAJ

mise à jour et transformation automatique de banques biologiques

Fiche Dev ESR Publié Français
Chemotaxis

approximation of PDEs models (parabolic, hyperbolic and kinetic models)

Fiche Dev ESR Publié Anglais
EZ-Rhizo

analyse de l'architecture racinaire de plantes en boite de Pétri

Fiche Dev ESR Publié Français
EDNA

environnement pour réaliser des programmes d'analyses de données en ligne

Fiche Dev ESR Publié Français
Free-D

reconstruction, visualisation et analyse de modèles 3D générés à partir d'images 2D ou 3D (biologie)

Fiche Dev ESR Publié Français
Stockoptions

gestionnaire de containers virtuels pour le laboratoire

Fiche Dev ESR Publié Français
MixNet/MixeR

statistiques : Mixture Models for Networks

Fiche Dev ESR Publié Français
Molecular Modelling Toolkit

bibliothèque de simulation moléculaire

Fiche Dev ESR Publié Français
DomainFinder

détermination et caractérisation des domaines dynamiques dans les protéines

Fiche Dev ESR Publié Français
Minbrkpts

performance testing of heuristics for the linearization of partial orders

Fiche Dev ESR Publié Anglais
BioRica

décrire et simuler les systèmes multi-modèles en biologie

Fiche Dev ESR Publié Français
EDNA

framework for plugin-based applications for online data analysis

Fiche Dev ESR Publié Anglais
QTLMap

détection de QTL dans les populations animales expérimentales

Fiche Dev ESR Publié Français
QTLMap

detection of QTL from experimental designs in outbred population

Fiche Dev ESR Publié Anglais
TASE

outil en ligne permettant la recherche de régions candidates par analyse de données SNP

Fiche Dev ESR Publié Français
pDynamo

modélisation moléculaire et simulation des protéines

Fiche Dev ESR Publié Français
ANISEED

modélisateur du développement de l'ascidie

Fiche Dev ESR Publié Français
ANISEED

representing and modeling the ascidian development

Fiche Dev ESR Publié Anglais
TASE

online tool for searching candidate regions from SNPs data

Fiche Dev ESR Publié Anglais
serial cloner

manipuler & visualiser des séquences d'ADN, préparer des projets de clonage

Fiche Dev ESR Publié Français
Ed'Nimbus

filtre de séquences ADN

Fiche Dev ESR Publié Français
Minbrkpts

tests des performances d'une heuristique permettant la linéarisation d'ordres partiels

Fiche Dev ESR Publié Français
SODA

dessin des oligonucléotides pour la méthode de clonage SLIC

Fiche Dev ESR Publié Français
ESPript

visualisation d'alignements multiples corrélés à la structure secondaire

Fiche Dev ESR Publié Français
NemoFish

analyse d'image pour les gènes et territoires chromosomiques en FISH 3D

Fiche Dev ESR Publié Français
EuGène

prédicteur de gènes pour les organismes eucaryotes et procaryotes

Fiche Dev ESR Publié Français
PFIM

evaluation et optimisation de protocoles de population

Fiche Dev ESR Publié Français
myProMS

validation, quantification et partage des données de spectrométrie de masse protéomique

Fiche Dev ESR Publié Français
T-lex

annotation d'éléments transposables à partir de données de séquençage (NGS)

Fiche Dev ESR Publié Français
PFIM

population design evaluation and optimisation

Fiche Dev ESR Publié Anglais
X!TandemPipeline

filtrage, édition, regroupement de résultats d'identifications MS

Fiche Dev ESR Publié Français
SVDetect

detection de variants structuraux à partir de lectures haut-débit appariées

Fiche Dev ESR Publié Français
X!TandemPipeline

edit, filter, merge and group your peptide/protein identifications from MS/MS mass spectra

Fiche Dev ESR Publié Anglais
GesCommLab

gestion des commandes pour laboratoires de la fonction publique

Fiche Dev ESR Publié Français
SVDetect

a tool to detect genomic structural variations from paired-end and mate-pair sequencing data

Fiche Dev ESR Publié Anglais
ScientiFig

création ou (re)formatage de figures pour les communications scientifiques

Fiche Dev ESR Publié Français
ScientiFig

create publication-ready scientific figures

Fiche Dev ESR Publié Anglais