Carte de restrictions de plasmides ou fragment ADN
Annotation rapide de plasmides.

• Recherche directe en blast sur NCBI

• Alignement de séquences
• Recherche d'ORF
• Recherche d'oligonucléotides.
• Possibilité de faire des recombinaisons de type LR et BP (Gateway, invitrogenTM)
• Possibilité d'aligner des électrophoregrammes de séquençage (type ABI) (mais pas plus de deux, donc pas de contiguage possible, plutôt pour faire des vérifications de clonage)

• Dixit Coralie Carron: Cet outil est utilisé au sein du laboratoire par une dizaine-quinzaine de personnes, notamment pour tout ce qui est collection de plasmides, clonage et plan de digestions pour vérification.
• Utilisé personnellement (Coralie Carron) pour plusieurs raisons: gratuit, utilisable sur Mac comme sous Windows, assez intuitif malgré une apparence trompeuse.
• Je (Nemo Peeters) ne l'utilise pas régulièrement, mais c'est bien fait.

• Pas de plan de clonage possible comme dans clonemanager.
• Pas d'annotations possibles sur les protéines, dommage que l'on ne puisse pas avoir la traduction directement sous la portion d'ADN
• Pas une grande documentation mais c'est suffisant pour comprendre globalement le fonctionnement.
• Manque une base de donnée intuitive intégrée.