CraneFoot
Le logiciel Cranefoot permet de visualiser graphiquement des arbres familiaux. Il permet d'en obtenir des représentations rapides et simples. L'utilisateur a la possibilité d'incorporer des informations supplémentaires concernant les individus, soit graphiquement pour un statut codé (malade ou non par exemple), soit textuellement directement pour une donnée.
Sortie des arbres sous différents formats.
Cranefoot est compatible avec le format linkage de représentation des relations familiales par triplets enfant-père-mère.
Les thématiques de recherche de mon laboratoire sont la détermination de facteurs génétiques de l'obésité et diabète. Ces travaux reposant sur des études familiales, Cranefoot est utilisé pour représenter graphiquement les arbres des familles étudiées. Les données sont stockées dans une base mysql, Cranefoot a été encapsulé dans une interface web pour une utilisation mutualisée au sein de l'unité. dans le cadre des différentes études réalisées. Il est aussi utilisé pour la représentation des haplotypes.
Pas de difficultés d'utilisation. Il faut préparer un fichier de données (format linkage) et un fichier de paramètres pour faire tourner le programme.
Commentaires
Lisible mais non conventionel
Un bon logiciel qui permet de tracer un arbre généalogique très rapidement et simplement.
+Possibilité de personnaliser le tracé et d'ajouter de l'information.
+Sortie au format PostScript facilement convertible en format image ou autre.
+Coloration des individus en quartier pour représenter le génotype.
-La duplication d'individu se veux faciliter la lisibilité de l'arbre mais cela donne lieu à une représentation non conventionnelle qui peut être délicate à lire pour quelqu'un qui découvre cette représentation.
-Quelques conventions absentes comme la représentation de jumeaux ou de consanguinité.
J'utilise moi même ce logiciel pour tracer mes arbres généalogiques.
Ces arbres sont ensuite affichés dans le logiciel que je développe : TASE (voir la fiche PLUME correspondante)
Je ne l'ai pas utilisé
Je ne l'ai pas utilisé intensément, mais testé.
Un des points forts de cranefoot, à mon avis, est qu'il duplique automatiquement et clairement les individus pour rendre le pédigrée lisible, même pour les grandes familles.
On peut aussi ajouter qu'il s'appuie sur graphviz, et permet de personnaliser très largement le pédigrée tracé. Le test disponible sur la version online signalée ci-dessus est une bonne démonstration.
Par contre, pas d'interaction possible avec le pédigrée : il s'agit d'une image (sauf peut-être au format SVG ?).
Recherche utilisateur
Nous n'avons pas trouvé d'autres sites de la communauté qui utilisent ce logiciel autre que celui de Lille. IL est donc en logiciel à valider. Si vous utilisez ce logiciel, mettez un commentaire, ce qui permettra éventuellement de basculer cette fiche en logiciel validé.