Monolix (pour MOdèles NOn LInéaires à effets miXtes) est un logiciel permettant l'estimation de paramètres de modèles mathématiques analytiques ou basés sur un système d'équations différentielles ordinaires dans un contexte populationnel. Le logiciel permet l'estimation des paramètres moyens dans une population d'individus ainsi que des caractéristiques des distributions aléatoires associées aux paramètres. Le domaine d'application principal est la pharmacocinétique et la pharmacodynamie des médicaments.

De nombreuses fonctionnalités sont implémentées dans Monolix :

• estimation des paramètres du modèle avec SAEM ;
• estimation de la vraisemblance du modèle par échantillonnage préférentiel ;
• sorties graphiques et numériques ;
• simulation de données ;
• librairies de modèles (pharmacocinétiques, pharmacodynamiques, dynamiques virales).

MLXTRAN est un traducteur intégré à Monolix qui permet à l'utilisateur d'écrire son modèle, en particulier lorsqu'il est défini par un système d'équations différentielles ordinaires.

Dans le cadre de leurs recherches en pharmacologie à L'INSERM-P7 ainsi qu'à l'INRA en agronomie, génétique animale et micro-biologie.
Ce logiciel est aussi utilisé et sponsorisé par de grands groupes pharmaceutiques tels que : Johnson & Johnson, Roche, Sanofi aventis, Exprimo et Novartis.

• Il n'existe actuellement pas de version serveur du logiciel.
• il n'existe pas de version script (obligation d'utiliser le GUI)