pDRAW32
Description
Fonctionnalités générales
pDRAW32 est un outil de biologie moléculaire qui permet :
-
annotations des cartes de plasmide
- gènes ou régions
- directions
- sites de restriction
- linéarité
- %GC
-
clonage virtuel
- définition bidirectionnelle des fragments (jusqu'à 3 fragments)
- gel virtuel
-
analyse de séquence
- ORF avec code génétique multiple
- primers
- methylation
- site de restriction
-
édition de séquence
- propriétés
- correction de séquence
- inversion/rotation
- recherche
-
graphique d'homologie 2D intra ou inter-séquence
-
calcul des paramètres pour les primers
Autres fonctionnalités
- Format multiple de présentation, d'impression et de copié/collé
- Mises à jour du fichier d'enzymes de restriction
- En supplément, un petit guide scientifique au format HTMLHelp
Interopérabilité
Exportation au format Windows Metafile pour modifications complémentaires
Importation depuis VectorNTI
Contexte d'utilisation dans mon laboratoire/service
Utilisations au laboratoire pour la préparation des clonages et diverses analyses de séquences nucléotidiques (reverse-complement, translation)
Limitations, difficultés, fonctionnalités importantes non couvertes
- Il n'y a pas d'outil de recherche automatisée de primers optimaux
- Pas de gestionnaire de séquences (plasmides et primers)
- Capacités d'alignement de séquences très limitées (XY plot)
Commentaires
ATTENTION à la licence
Attention : Ce logiciel est passé d'une licence GPL libre à une licence propriétaire gratuite !
Comme indiqué par le contributeur dans la partie Licence de cette fiche, "Le logiciel est passé Shareware, toutes les fonctionnalités sont accessibles sans coût, Cependant l'auteur prévoit des "privilèges" pour les installations payantes dans un futur proche..."
pDraw vs Vector NTI
pDraw constitue une alternative libre à Vector NTI, qui n'est plus du tout E (économique, licence payante et très chère même pour les académiques), d'où la mise en archive de la fiche plume Vector NTI