FATAL

Fiche dév Ens Sup - Recherche
  • Création ou MAJ importante : 22/02/11
  • Correction mineure : 22/02/11
Mots-clés

FATAL : génération automatique de portail Web pour l'annotation fonctionnelle

Ce logiciel a été développé (ou est en cours de développement) dans la communauté de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche. Son état peut être variable (cf champs ci-dessous) donc sans garantie de bon fonctionnement.
  • Site web
  • Système : UNIX-like
  • Licence(s) : CeCILL
  • Etat : diffusé en beta
  • Support : maintenu, développement en cours
  • Concepteur(s) : Sébastien CARRERE
  • Contact concepteur(s) : sebastien.carrere@toulouse.inra.fr
  • Laboratoire(s), service(s)... : LIPM

 

Fonctionnalités générales du logiciel

FATAL automatise le déploiement de portails web nécessaires à l'analyse fonctionnelle de séquences. FATAL a été développé en particulier pour l'analyse de transcrits (clusters d'ESTs typiquement) et peptides associés, mais peut être utilisé pour analyser tout type de séquence.

Le principe est le suivant : à partir d'un lot de séquences et d'un fichier de configuration, FATAL construit un portail web ainsi qu'un lot de scripts afin de :

  1. exécuter des analyses fonctionnelles (interpro, blasts), stocker et indexer les résultats,
  2. générer un portail web comprenant les outils standards de la bioinformatique (navigateur, moteur de recherche, serveur blast, serveur PatScan).
Contexte d’utilisation du logiciel