Molecular Modelling Toolkit

Fiche dév Ens Sup - Recherche
  • Création ou MAJ importante : 13/10/08
  • Correction mineure : 04/11/11
Mots-clés

Molecular Modelling Toolkit : bibliothèque de simulation moléculaire

Ce logiciel a été développé (ou est en cours de développement) dans la communauté de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche. Son état peut être variable (cf champs ci-dessous) donc sans garantie de bon fonctionnement.
  • Site web
  • Système : UNIX-like, Windows, MacOS X
  • Version actuelle : 2.5.24 - septembre 2008
  • Licence(s) : CeCILL-C
  • Etat : diffusé, stable
  • Support : maintenu, développement en cours
  • Concepteur(s) : Konrad Hinsen
  • Contact concepteur(s) : hinsen@cnrs-orleans.fr
  • Laboratoire(s), service(s)... : CBM

 

Fonctionnalités générales du logiciel

Bibliothèque logicielle de simulation moléculaire :

  • manipulation d'objets chimiques
  • calcul d'énergies d'interaction
  • dynamique moléculaire
  • modes normaux
  • minimisation d'énergie
  • solvatation
  • gestion de trajectoires
  • interface à la visualisation
Contexte d’utilisation du logiciel

MMTK est développé en langages Python, Pyrex et C. Les programmes et bibliothèques nécessaires à son utilisation sont :

  • Python >= 1.5
  • Numerical Python >= 20 ou NumPy >= 1.0
  • netCDF >= 3.4
  • ScientificPython >= 2.6
  • Compilateur C
Publications liées au logiciel

Journal of Computational Chemistry, volume 21, numéro 2, pages 79-85, 2000