MoPro

Fiche dév Ens Sup - Recherche
  • Création ou MAJ importante : 28/09/11
  • Correction mineure : 28/09/11
Mots-clés

MoPro : analyse de la structure et densité électronique moléculaire (cristallographie)

Ce logiciel a été développé (ou est en cours de développement) dans la communauté de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche. Son état peut être variable (cf champs ci-dessous) donc sans garantie de bon fonctionnement.
  • Site web
  • Système : UNIX-like, Windows
  • Version actuelle : 2011 - septembre 2011
  • Licence(s) : Licence propriétaire - Le logiciel (binaires seuls) est téléchargeable après enregistrement sur le site de mopro pour un usage non commercial.
  • Etat : diffusé, stable
  • Support : maintenu, développement en cours
  • Concepteur(s) : Christian Jelsch
  • Contact concepteur(s) : christian.jelsch@uhp-nancy.fr
  • Laboratoire(s), service(s)... : CRM2

 

Fonctionnalités générales du logiciel
  • Affinement de la structure cristallographique et de la densité électronique à très haute résolution (d=0.5 Angstrom)
  • Affinement de la structure cristallographique des petites molécules à résolution usuelle

La densité électronique est alors modélisée avec un modèle d'atomes multipolaires, ce qui est plus précis que le modèle d'atomes sphériques et neutres. Il en résulte une meilleure estimation des coordonnées atomiques et facteurs de température, le facteur R est meilleur.

Le logiciel comprend une banque de données ELMAM2 qui décrit la densité électronique des fonctions chimiques communes.

MoProSuite comprend :

  • MoProGUI interface graphique du logiciel (langage JAVA)
  • Import2Mopro, MoPro (affinement cristallographique) & VMoPro (visualisation des propriétés moléculaires)
  • MoProViewer (visualisation des molécules et interface graphique)
Contexte d’utilisation du logiciel

MpPro est utilisé pour :

  • Les structures cristallographies de petites molécules et protéines. Toutefois, pour ce qui est des macromolécules, MoPro n'est pas encore mûr pour une utilisation en routine. Les auteurs sont ouverts à l'établissement de collaborations avec les biologistes pour approfondir ce point.
  • Détermination de la densité électronique moléculaire.
  • Calcul de propriétés moléculaires : potentiel électrostatique avec modèle d'atome multipolaire, moment dipolaire, énergies d'interaction électrostatique.
Publications liées au logiciel
  • Jelsch, C., Guillot, B., Lagoutte, A. & Lecomte, C., (2005). J. Appl. Cryst. 38, 38-54.
    Advances in Proteins and Small Molecules. Charge Density Refinement Methods using software MoPro.
  • Guillot B., Viry L., Guillot R., Lecomte C. & Jelsch C. J. Applied Crystallography (2001). 34, 214-223.
    Refinement of proteins at subatomic resolution with MOPRO.
  • Domagala, S. & Jelsch, C. (2008). J. Applied Cryst. 41, 1140–1149
    Optimal local axes and symmetry assignment for charge-density refinement