Format BAR : Binary ARchive (Génome)
Acronyme : BAR
Nom complet : Binary ARchive
Description courte : Fichier binaire.
Format pour décrire des informations d'analyse (signal, p-value pour des positions génomiques) de tiling array. Ce format a été créé par Affymetrix mais d'autres logiciels se le sont appropriés.
Extension par convention : .bar
Document de standardisation : http://www.affymetrix.com/support/developer/powert...
Avantages : Est peu volumineux comparé à un fichier texte.
Inconvénients :
- La lecture du fichier n'est pas aussi aisée pour que un fichier texte.
- Dépend de la norme utilisée pour lire le fichier bar.
Utilisations recommandées :
Souvent utilisé pour des données de ChIP on Chip (Chromatin ImmunoPrecipitation on Chip) ou de chIP-seq (ChIP-Sequencing)
Logiciels de traitement les plus connus :
- Tiling Analysis Software d'Affymetrix, format accepté en entrée et en sortie
- IGB, format accepté en entrée
- Cisgenome, format généré