DomainFinder : détermination et caractérisation des domaines dynamiques dans les protéines

Ce logiciel a été développé (ou est en cours de développement) dans la communauté de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche. Son état peut être variable (cf champs ci-dessous) donc sans garantie de bon fonctionnement.
Fiche dév Ens Sup - Recherche
  • Création ou MAJ importante : 13/10/08
  • Correction mineure : 04/11/11
  • Auteur de la fiche : Konrad Hinsen (Centre de Biophysique Moléculaire)
  • Responsable thématique : Christelle Dantec (CRBM)
Mots-clés
Fonctionnalités générales du logiciel
  • Calcul de flexibilité dans une protéine
  • Identification de domaines dynamique dans une protéine

Le langage de développement est Python. Les programmes et librairies nécessaires à l'installation sont :

  • Python >= 1.5
  • Numerical Python >= 20
  • ScientificPython >= 2.4
  • netCDF >= 3.4
  • MMTK >= 2.4
  • Tcl/TK >= 7
Contexte d’utilisation du logiciel

DomainFinder est destiné aux chercheurs en biologie structurale ou en biophysique qui cherchent à obtenir des informations sur la flexibilité d'une protéine à partir de sa structure.

Publications liées au logiciel

Proteins, volume 34, numéro 3, pages 369 - 382, année 1999.