DomainFinder

Fiche dév Ens Sup - Recherche
  • Création ou MAJ importante : 13/10/08
  • Correction mineure : 04/11/11
Mots-clés

DomainFinder : détermination et caractérisation des domaines dynamiques dans les protéines

Ce logiciel a été développé (ou est en cours de développement) dans la communauté de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche. Son état peut être variable (cf champs ci-dessous) donc sans garantie de bon fonctionnement.
  • Site web
  • Système : UNIX-like, Windows, MacOS X
  • Version actuelle : 2.0.4 - avril 2008
  • Licence(s) : CeCILL-C
  • Etat : diffusé, stable
  • Support : maintenu, développement en cours
  • Concepteur(s) : Konrad Hinsen
  • Contact concepteur(s) : hinsen@cnrs-orleans.fr
  • Laboratoire(s), service(s)... : CBM

 

Fonctionnalités générales du logiciel
  • Calcul de flexibilité dans une protéine
  • Identification de domaines dynamique dans une protéine

Le langage de développement est Python. Les programmes et librairies nécessaires à l'installation sont :

  • Python >= 1.5
  • Numerical Python >= 20
  • ScientificPython >= 2.4
  • netCDF >= 3.4
  • MMTK >= 2.4
  • Tcl/TK >= 7
Contexte d’utilisation du logiciel

DomainFinder est destiné aux chercheurs en biologie structurale ou en biophysique qui cherchent à obtenir des informations sur la flexibilité d'une protéine à partir de sa structure.

Publications liées au logiciel

Proteins, volume 34, numéro 3, pages 369 - 382, année 1999.