ScientiFig

Fiche dév Ens Sup - Recherche
  • Création ou MAJ importante : 15/11/13
  • Correction mineure : 15/11/13

ScientiFig : création ou (re)formatage de figures pour les communications scientifiques

Ce logiciel a été développé (ou est en cours de développement) dans la communauté de l'Enseignement Supérieur et de la Recherche. Son état peut être variable (cf champs ci-dessous) donc sans garantie de bon fonctionnement.
  • Site web
  • Système :
  • Version actuelle : 2.6 - 02/10/2013
  • Licence(s) : BSD -
    ScientiFig utilise les composants BATIK et XML-apis, sous licence Apache, et Rsession, sous licence BSD.
  • Etat : diffusé en beta
  • Support : maintenu, sans développement en cours
  • Concepteur(s) : Benoit Aigouy
  • Contact concepteur(s) : Benoit Aigouy
  • Laboratoire(s), service(s)... :

 

Fonctionnalités générales du logiciel

Les chercheurs passent un temps considérable à réaliser des figures pour leurs communications scientifiques (présentations orales, publications dans des revues scientifiques, ...). Pour réaliser cette tâche, ils utilisent le plus souvent des logiciels conçus pour des graphistes qui ne sont pas adaptés à la création de figures "scientifiques".

ScientiFig, au contraire, est dédié spécifiquement à la production de figures formatées pour la recherche. C'est un plugin de FIJI/ImageJ et/ou un standalone, les trois utilisations sont possibles. Il permet d'assembler de manière cohérente des panneaux d'images de même tailles ou de tailles différentes, de leur associer une barre d'échelle et des annotations dont la position est préservée même lorsque l'utilisateur change la taille de la figure. ScientiFig peut exporter les figures générées au format png avec un fond transparent pour une meilleure intégration dans les documents bureautique ou au format vectoriel (pour être finalisé dans un éditeur d'images vectorielles). ScientiFig permet enfin de formater des figures pour différents journaux (il est aussi possible de créer, avec l'éditeur intégré, un nouveau style si le journal qui vous intéresse est absent), il suggère une taille de figure compatible avec le journal, le remplacement des polices non conformes, ...

On peut citer à titre de comparaison ces logiciels alternatifs :

Contexte d’utilisation du logiciel

ScientiFig est un logiciel d'assemblage/montage et de formatage d'images pour des publications scientifiques.

Publications liées au logiciel

ScientiFig: a tool to build publication-ready scientific figures. Aigouy B, Mirouse V. Nat Methods. 2013 Oct 30;10(11):1048. doi: 10.1038/nmeth.2692.