serial cloner
Serial Cloner permet de produire :
- des cartes de restriction graphiques et textuelles où les sites de restrictions et 'Features' sont visibles,
- de trouver les sites uniques, absents,
- de produire des cartes de restriction "silencieuses".
Il est aussi possible de réaliser des restrictions et PCR virtuelles, de préparer des adaptateurs ou shRNA et de réaliser des clonages par ligation ou par recombinaisons homologues. Serial cloner produit aussi des alignements de séquences en local ou via le NCBI. Une interface Web est incluse, utile notamment pour récupérer des séquences sur les serveurs de l'EBI ou du NCBI. La version 2.5 gère aussi les séquences protéiques.
L'interface a été pensée pour permettre un accès rapide aux paramètres de présentation et aux différentes fonctions.
Les fichiers produits sont lisibles par DNA Strider et un export au format GenBank et Fasta est possible. Les fichiers au format texte, fasta, GenBank, EMBL, Ape, pDRAW MacVector et Vector NTI peuvent être importés.
Serial Cloner existe pour MacOSX et WIndows (XP, Vista, Seven). Une version Linux, moins avancée, est aussi disponible.