X!TandemPipeline
Fonctionnalités générales du logiciel
X!TandemPipeline est un logiciel libre qui propose une interface graphique pour visualiser et manipuler des résultats d'identifications de protéines par spectrométrie de masse (MS/MS).
Les principales fonctionnalités sont :
- Identification de protéines avec le logiciel X!Tandem
- Chargement de résultats d'identification au format Mascot (.dat) ou X!Tandem
- Application de filtres statistiques sur les peptides ou les protéines
- Calcul de taux de faux positifs (FDR)
- Filtrage de la redondance, regroupement des protéines par fonction
- Mode "Phopshoprotéomique" pour traiter efficacement les peptides phosphorylés
- Interface graphique pour visualiser, filtrer, éditer les résultats
- Export des données au format Open Document (compatible MS Office 2010 ou LibreOffice)
- Support de la quantification avec l'export au format MassChroQml (MassChroQ)
- Facile à installer sur tous les systèmes
- Support via la liste "pappso-tools [at] listes [dot] inra [dot] fr"